阳光明媚的一天，大街上熙熙攘攘，人来人往。然而，有一个名叫小智的小孩却总是遭受同学们的嘲笑。原因无他，小智总是喜欢画一些怪兽的画像，并且还经常向同学们吹嘘这些怪兽是真实存在的。当然，同学们对此并不相信，他们认为小智只是在编造故事来吸引大家的注意。小智的母亲也对他这种行为感到不满，她希望小智能够放弃这些不切实际的幻想，专注于学习。
面对他人的不理解和嘲笑，小智并没有在意。他坚信自己所画的怪兽是真实存在的，因为他最信任的老师——中谷曾经告诉他怪兽是真实存在的。中谷是一位知名的生物学家，他的话让小智深信不疑。
与此同时，中谷正带领一群生物学家前往南太平洋未开发的乔森岛进行生态系统研究。这次探险得到了科特队的保护，他们计划在岛上建立一座博物馆。出发前，中谷曾与小智分享过这个消息，并提到乔森岛可能生活着怪兽。这使得小智对怪兽的信念更加强烈。
然而，就在这时，勇治的心情却异常沉重。作为一名勇敢的战士，他被派遣参与这次行动，但他内心并不情愿。一方面，这次任务破坏了他宝贵的假期；另一方面，他认为人类试图研究怪兽的行为是极其愚蠢的，这将不可避免地激怒那些强大的怪兽，因为人类的这些行为不仅打扰到它们，还破坏了它们现在生存的环境。
第二天清晨，太阳缓缓升起，阳光洒在了乔森岛上，给整个岛屿带来了一丝生机与活力。
科特队队长村松敏夫带领着队员们，与中谷博士和其他生物学家一同踏上了探索乔森岛的征程。他们小心翼翼地前行，期待着能够揭开这座神秘岛屿的面纱。
就在这时，一阵低沉的轰鸣声打破了宁静。大家惊愕地望向声音传来的方向，只见一座山开始微微颤抖起来。随着山体的震动，一块巨石从山顶滚落下来，扬起一片尘土。紧接着，一个庞大的身影从山中钻了出来。
那是一只巨大的怪兽，身躯高大而威猛，身上覆盖着坚硬的鳞片，尾巴粗壮有力。它的出现让人们不禁倒吸一口凉气，恐惧弥漫在空气中。
然而，中谷博士和他的同伴们却显得异常兴奋。他们眼中闪烁着好奇和惊喜的光芒，仿佛看到了一件珍贵的宝物。原来，这只怪兽正是他们一直梦寐以求想要研究的对象——古代怪兽哥莫拉。
科特队的队员们深知不能轻易激怒这只强大的怪兽，以免引发不可预测的后果。于是，他们决定保持警惕，暂不发动攻击，观察哥莫拉的行动。
与此同时，关于发现哥莫拉的消息迅速传遍了整个城市。这个令人震惊的新闻引起了广泛的关注和热议。
小智作为第一个发现怪兽的人，成为了焦点人物。人们对他充满了敬意和感激之情，将他视为英雄。那些曾经嘲笑过小智的同学们纷纷前来道歉，他们意识到自己之前的错误判断，并对小智表示由衷的钦佩。
小智的心中充满了自豪和满足感。他从未想过自己会如此受到大家的认可和赞扬。他的努力和勇气终于得到了回报，这一刻，他觉得一切都是值得的。
随着时间的推移，小智逐渐适应了新的身份，他的名字也被冠上了“怪兽殿下”的称号。他以一种全新的姿态面对生活，展现出坚韧和自信的一面。
“中谷博士他们在国外已经订购了强力麻醉剂，可以将哥莫拉麻醉6个小时，上面决定让我们先将哥莫拉带到大阪地区安顿下来”村松队长在科特队总部对队员说道。
“哎，不去打扰它该多好，那样它对地球人也不会有敌意，看来一场灾难在所难免”勇治内心中无奈的想道。
“看来还得我出马了，只能将怪兽送到其他适合它的星球上去了。”勇治坚定的想道。
“早田，朝仓，岚，井手你们去配合中谷博士执行任务，麻醉的工作的话，还是得我们科特队做，井手就由你来做吧。”村松队长吩咐道。
“明白”科特队众人准备好后乘着威托号向哥莫拉的地点进发。
来到哥莫拉的所在地后，井手对哥莫拉进行了麻醉，并取得了成功，科特队众人用网将哥莫拉挂在几架威托号上开始了搬运工作，在大家都以为会非常顺利时，勇治内心却十分不安。
很快这份不安得到了验证，哥莫拉在中途苏醒了过来，它剧烈的挣扎险些让威托号坠机，无奈科特队众人只能先将哥莫拉放在了一处山谷中。
哥莫拉获得自由后赶紧挖地洞离开了，科特队赶紧疏散山谷附近的村民，但小智和他们的父母却不打算搬离，说死了就是命运之类的。
不久后哥莫拉来到山谷附近的一家工厂内，而小智为了近距离看哥莫拉，把自己陷进了危险之中，还大声呼唤着奥特曼，很明显他内心深处并不是喜欢怪兽，而是更喜欢奥特曼打怪兽的场景。
早田感应到了有人呼唤他，便变身奥特曼和哥莫拉战斗在了一起，但奥特曼明显低估了哥莫拉的实力，被压着打。
“哎，还得我出场”勇治拿出捷德升华器
“高斯奥特曼”
”希卡利奥特曼”
“融合升华”
“捷德奥特曼机敏形态”
一道亮光闪过，捷德出现在正在暴打奥特曼的哥莫拉身边，哥莫拉马上改变了目标向捷德冲来，捷德一个空翻敏捷躲过，之后一个飞踢踢在了哥莫拉背后，将它踢到在地。
奥特曼见此想继续攻击，捷德将他拦了下来。
“满月光波”捷德第一次试着使用高斯的力量，一道温和的光线照在哥莫拉身上。
哥莫拉躁动的情绪得到了缓解，不再那么生气了。
“哥莫拉我知道你生气的缘由，既然你现在无法接受人类，那我带你换一个星球生活吧”捷德用心灵感应提议道。
哥莫拉想了想对着捷德点了点头。
捷德也对奥特曼示意了一下，就带着哥莫拉去宇宙寻找一颗适合它生活的星球，到达那里后，哥莫拉又陷入了沉睡，显然之前的事情耗费了它不少体力。
这次的事件也算圆满结束，但中谷博士一行人对捷德却充满了厌恶，因为他们的研究对象被带走了，这些捷德都不以为意，从心而做是捷德的本心，不会受他人干扰。