时光荏苒，转眼间，皇太极与德川幕府之间的那场惊心动魄的交战已经过去了整整两年。然而，这场战役所带来的影响却如同涟漪一般，在岁月的长河中不断扩散，深远而持久。
尤其是德川家光，他在这场战争中连续两次遭受皇太极的重创，最终不得不无奈地牺牲津轻家和南部家的利益来换取暂时的和平。这一举动不仅让日本国内的藩主们对他大失所望，更让他们心寒至极。
从此以后，除了德川家族的分支以及少数与德川家光关系密切的亲信藩主仍然愿意听从他的指挥外，那些远在九州、四国和中国地区的藩主们已经完全变成了既不听从调遣也不接受诏令的独立势力。日本国内的内乱由此愈发明显，各种矛盾和冲突不断升级，局势变得越来越紧张。
而这一切，都如同摆在朱由校面前的一幅清晰画卷，毫无遗漏地展现在他的眼前。日本的情报如潮水般源源不断地涌入大明，朱由校敏锐地察觉到，攻打日本的时机已经悄然成熟。
此时此刻的日本，德川幕府的威望一落千丈，各地的一揆运动如野火燎原般愈演愈烈。面对如此汹涌的民变浪潮，德川幕府不得不调集更多的军队去镇压叛乱。然而，军队数量的增加意味着军费开支的大幅增长，这无疑给本就捉襟见肘的幕府财政带来了更为沉重的负担。
为了缓解财政压力，幕府又不得不从各地藩主身上征收更多的赋税。
各地藩主为了满足幕府的需求以及自身的利益，妄图把农业先进地区业已大量存在的小自耕农重新沦为农奴。
这种倒行逆施的行为，自然引发了更大的反抗。
天启十二年九月（1632年）长崎港一家明人开办的酒屋包厢里，大明日本军情司副司长郭国安，秘密会见了一名年仅十二岁的少年。
这名少年名叫天草时贞，本名益田时贞。其父名益田好次，肥后国大名小西行长的家臣。后来时贞被过继给天草甚兵卫，改名为天草时贞，小名四郎。时珍自小聪颖过人，有神童之称，且外表俊秀。有一位相士曾对天草说：“阁下面相尊贵，本应掌握天下，只可惜生在德川时代，难成大事。”
关原合战后小西行长被斩首，领地遭改易，家臣们纷纷四散成为浪人，时贞从小跟随养父天草甚兵卫就居住在长崎港。
经过军情处多年观察之后，终于在今时今日，郭国安亲自接见了这个少年。
郭国安直接开门见山的向时贞提出了，自己代表萨摩藩，大明在日商人等名义，资助其发动一揆。
聪明的时贞立马就领悟到了郭国安的用意。
时任将军的德川家光奉行的是闭关锁国政策，这对倚重于海上贸易的萨摩藩来说绝对是不可接受的事情。自从明荷澎湖海战之后，如今的长崎港，再也看不到悬挂荷兰东印度公司旗帜的商船，络绎不绝的大明大小商船比比皆是。
双方之间利益相同，时贞养父和亲父因德川幕府而从家臣变成了浪人，因此其对德川家异常仇恨。而对面的郭国安代表着谁的利益，时贞并不是真正感兴趣，只要对方愿意资助自己发动一揆，那么对方便是自己的盟友。
少年老成的时贞开口说道：“那么贵客能给小子提供什么样的资助？”
郭国安饮了一杯烧酒，吧唧了下嘴巴，回答说：“我在云仙岳给你隐藏了五百名野人，两千条明制火绳枪，五门明制十二磅炮，长枪、短刀若干。粮草五千石，白银五万两。”
“对了，阿苏山还有一座无人居住的城寨，我给你的建议是，广积粮，缓起事。”
郭国安说完，天草时贞倒吸一口凉气，一脸震惊之色再也藏不住。
如此之多的物资，足以给其武装五千人有余，而且对面之人所说的五百野人，应该也是久经沙场的精锐之士。
搞得他有点纳闷了，其完全可以不用自己出面，就能拉起一支起义军，但又为何需要自己出面呢？
于是他忍不住问道：“既然阁下有如此神通，为何要找我这个乳臭未干的小子？而且，我还没到元服的年纪。”
实际上郭国安也不清楚军情局为何会找上这位十二岁的少年，但山峰有令，他又不能不执行。
于是他回答道：“在你幼年时，是否有一位相士为你相过面？你的所有情况我都了如指掌，所以我认为你可以，你就可以。还有，这只是前期的援助，未来我们会安排运送更多的物资给你。”
该交代的事情已然交代，郭国安没有给时贞留出考虑时间。他拍了拍时贞的肩膀，诱惑道：“德川幕府能分封藩国，我们也能。”
时贞豁然起身，“你究竟是谁？你背后站着的到底是谁？”
郭国安哈哈大笑，给了他一个以后你就知道了的眼神，就步出了包厢，独留天草时贞一人在包厢。
第二日清晨，天草时贞亲赴云仙岳，正式接管了那五百野人以及那批庞大的物资。
此后三个月，肥前、肥后、筑前、筑后数千浪人被秘密转移到了秘密基地。
天启十三年（1633年）三月，年仅十三岁的天草时贞在岛原半岛云仙岳高举义旗，正式打出了反对幕藩封建压迫的大起义。
五千名端着火绳枪，还有五门火炮的起义军，于三月六日下山迅速攻占了毫无防备的岛原城，将藩主松仓胜家赶出了领地。
三月十五日，起义军暴增至一万五千人。随即，天草时贞兵分两路，一路沿海岸线南下，迅速攻占深江、有家、有马、原城。一路由其亲率，沿海岸线北上，迅速攻占东古关、多比良、神代，以及爱野。
短短不到一个月时间，天草时贞便迅速占领了整个岛原半岛。起义军也从五千人迅速膨胀到了三万余。
这几乎将整个岛原半岛的所有贫民、浪人，甚至连妇女都包括在内。
五月，天草起义军渡过岛原湾抵达天草岛，迅速得到了岛民的欢迎，天草岛领主寺泽氏狼狈逃离该岛。