终末之谷的轰鸣声渐渐平息，只剩下瀑布奔腾的哗哗声和偶尔岩石滚落的声响，反而衬托出一种死寂。月光照亮了战场上的狼藉，巨大的坑洞、断裂的树木、焦黑的土地，无不诉说着刚才那场战斗的惨烈。
止水单膝跪地，右手捂住依旧传来阵阵刺痛和模糊感的右眼，剧烈地喘息着。最后那一下“定点湮灭”几乎抽空了他大半的瞳力和仙术查克拉，甚至触及了本源，带来的负担远超想象。但他强撑着没有倒下，目光警惕地扫视着周围，确认是否还有隐藏的威胁。
自来也和卡卡西迅速清理完残余的抵抗，来到止水身边。
“没事吧，止水？”自来也关切地问道，手掌按在止水背上，温和的仙术查克拉涌入，帮助他稳定紊乱的气息。
“还好……只是消耗太大。”止水摇了摇头，声音有些沙哑。
卡卡西则看着团藏消失的那个巨坑，写轮眼中情绪复杂，有解脱，也有沉重。“终于……结束了吗？”
“团藏是死了，但他留下的烂摊子才刚刚开始。”自来也叹了口气，神色凝重，“根的势力盘根错节，那些实验数据和‘黑色碎片’的来源也必须查清。木叶……需要时间来自我清理和愈合。”
这时，几名参与行动的暗部上忍前来汇报：“三代目大人那边传来消息，村子内部的镇压和清理行动基本完成，大部分根部成员选择投降，少数顽固分子被控制或清除。火影大人请几位尽快回去主持大局。”
行动比预想的要顺利，显然三代目在国内也做了充分的准备，并且团藏的伏诛极大地打击了根的士气。
“走吧，这里交给后续部队处理。”自来也拍了拍止水的肩膀。
止水点了点头，在两人的搀扶下站起身。最后看了一眼那片战场，尤其是那几颗散落在焦土中的、已经失去光泽的写轮眼碎片，他心中百感交集。这些眼睛，曾经属于那些被迫害、被利用的宇智波族人，如今随着团藏的灭亡，或许终于可以得到安息了。
他默默结了几个简单的印，一股微弱的火苗弹出，将那些碎片小心地焚化，让它们尘归尘，土归土。
做完这一切，三人才转身，向着木叶的方向离去。
回到木叶时，天色已近黎明。村子看似平静，但空气中依旧弥漫着紧张的气氛。街道上有暗部和正规忍者巡逻，偶尔能看到被控制带走的根部成员。村民们大多紧闭门窗，显然对夜间发生的动荡有所察觉，充满了不安。
火影大楼灯火通明。三代目猿飞日斩仿佛一夜之间又苍老了许多，但眼神却比以往更加坚定。看到止水三人安全归来，他明显松了口气。
“辛苦你们了。”三代目的声音带着疲惫，却也有一丝如释重负，“团藏已伏诛，根组织主要力量已被瓦解，木叶……迎来了一个新的开始。”
接下来的几天，木叶高层陷入了前所未有的忙碌之中。
三代目迅速发布了一系列命令：公开团藏的部分罪行（省略了关于宇智波和写轮眼的敏感细节），安抚村民情绪；彻底清查根组织所有基地，销毁危险实验数据和产物，妥善安置被洗脑的根部成员；提拔一批可靠的上忍填补权力空缺，加强村子防卫力量。
止水、卡卡西和自来也也参与了后续的清理工作，特别是对根组织基地的搜查。在团藏的主基地最深处，他们发现了更多令人触目惊心的东西：大量写轮眼的储存罐、初代细胞的培养液、以及关于“神树碎片”的零星实验记录——指向了一个名为“极乐之箱”的古老传说以及某个神秘的海外遗迹。遗憾的是，关于碎片的具体来源和更多研究资料，似乎被团藏提前销毁或转移了。
“极乐之箱……神树碎片……”自来也看着那些残缺的记录，眉头紧锁，“这些东西，似乎与六道仙人的传说有关。团藏到底从哪里得到的？他又想用它来做什么？”
“必须彻底调查清楚。”三代目沉声道，“这些东西太危险，绝不能落入晓组织或其他野心家手中。”
在此期间，止水得到了最好的医疗照顾和恢复时间。他右眼的负荷逐渐缓解，视力恢复清晰，并且因为经历了高强度的实战和突破，他对仙术须佐和新生瞳力的掌控更进了一步。他时常去探望依旧在休养中的鼬和佐助。
佐助已经苏醒，身体已无大碍，但对那晚的经历记忆模糊，只记得自己差点被坏人抓走，是止水和卡卡西救了他。对于止水“死而复生”和那强大的力量，他充满了好奇和……一丝不易察觉的羡慕与渴望。止水没有告诉他全部真相，只是温和地鼓励他好好修行，不要被仇恨蒙蔽双眼。
而鼬，在得知团藏伏诛、佐助脱险的消息后，一直紧绷的精神似乎终于放松了一些，身体状况有了明显的好转。虽然视力恢复希望渺茫，但他至少摆脱了最大的生命威胁。两兄弟在病房里进行了一次长时间的、无人打扰的谈话。止水将包括南贺秘卷、四代目线索、“契约”理念在内的所有情报和想法，都告诉了鼬。
鼬静静地听着，苍白的脸上露出了久违的、真正释然的笑容。“止水，你找到了一条……真正属于宇智波的道路。一条充满希望的道路。”他轻声说，“我会尽全力支持你。等我再好一些，或许……我这对眼睛残存的力量，也能为你提供一些帮助。”他指的是通过“契约”的方式，而非掠夺。
木叶的局势渐渐平稳下来。但所有人都知道，内部的危机暂时解除，外部的威胁却从未远离。晓组织依旧隐藏在暗处，收集着尾兽，推行着“月之眼计划”。带土（阿飞）在得知团藏死亡和止水力量大增的消息后，又会采取怎样的行动？
这天傍晚，止水独自一人来到南贺神社旧址。这里依旧荒废，充满了萧索的气息。他站在那块被篡改的石碑前，右眼万花筒缓缓旋转。
在仙术瞳力的注视下，石碑上被掩盖和扭曲的刻文，似乎变得更加清晰了一些。他看到了更多关于“阴阳合一”的模糊描述，提到了“森罗万象之力”源于“理解与调和”，而非“征服与吞噬”。也提到了“神树”是查克拉的起源，但其力量被扭曲利用则会带来灾祸。
结合四代目的提示、自来也的知识以及自身的感悟，止水心中的道路越发清晰。
“契约……理解……调和……”他喃喃自语，“或许，真正的‘阴阳合一’，并不仅仅是千手与宇智波的力量融合，而是更本质的，对查克拉本身、对自然能量、对生命意志的一种深刻理解与共鸣。”
他想到了与体内二尾查克拉的微弱共鸣，与自然能量的沟通，与右眼新生瞳力的“契约”。这一切，似乎都指向同一个方向。
就在这时，他怀中的一只小型通讯蛤蟆突然发出了声音：“止水大人，自来也大人请您立刻去火影办公室一趟，有紧急情况！”
止水心中一凛，立刻瞬身离开。
火影办公室内，气氛再次变得紧张。自来也和三代目脸色凝重地看着一份刚刚由潜入雨之国的暗线拼死传回的情报。
“根据可靠情报，晓组织首领佩恩，及其成员小南、干柿鬼鲛，已经确认离开了雨之国基地。”自来也沉声道，“他们的目标……极有可能是云隐村的八尾人柱力，奇拉比！”
“而且，”三代目补充道，目光看向止水，“情报还提到，那个自称‘宇智波斑’的面具男（带土），在组织内部公开表达了对‘木叶新生的翠色光芒’的浓厚兴趣。止水，他恐怕已经将你视为，必须优先清除或捕获的重要目标了。”
新的风暴，已然掀起。木叶短暂的喘息之期结束，更大的挑战就在眼前。
止水握紧了拳头，右眼中翠绿色的光芒坚定而璀璨。
“云隐……八尾……还有带土……”他知道，下一场战斗，将不再局限于木叶内部，而是真正卷入整个忍界的纷争。
黎明的前夜，或许最为黑暗。但他已握紧手中的光，无所畏惧。