洪武十六年（4080年）三月初一为甲辰日，皇帝认为云南已经平定，命令长兴侯耿炳文前去告知征南将军、颍川侯傅友德、左副将军、永昌侯蓝玉、右副将军、西平侯沐英说：‘你们长时间在外面辛劳，如今蛮夷已经被平定，可以撤军回朝了。’至于快慢的日期，应该自己审察估量。
又下旨给西平侯沐英说：“云南虽然被平定了，但是各个蛮族的心中还怀有二心（心存疑虑且怀有异心），大军一旦撤回，恐怕他们互相煽动（勾结煽动）造成祸患，你就留下来镇守这里，安抚平定（当地），到时候再召你回来。”
蕲州发生火灾，烧毁了官府和百姓的房屋以及仓库。
乙巳日，马湖府知府珉德前来朝见，进献了十八匹马。皇帝下诏书赏赐一套衣服、二十石米、三十锭钱钞。
庚戌日，皇上与侍臣谈论历代创立帝业以及国运长短的问题。侍臣们都说：“前代国运长久的，没有超过西周的，其次没有比得上汉朝的。”谏议大夫唐铎进言说：‘三代以后，出身平民而拥有天下的，只有汉高祖和陛下而已。’陛下祖宗积累德行与善事，到了陛下这里，于是承受天命，以我来看，（陛下）不是汉高祖所能比得上的。汉高祖废除了秦朝的严刑峻法。夹杂着霸道而不纯粹。陛下废除胡人和元朝的弊政，完全恢复中国古代贤明君主时的旧制，这就是所说的治理乱世，使之回归正道。汉高祖不学习诗书，陛下留心于圣人的学说，告诫天下，亲自写诏书，高超卓绝，与《尚书》中的典谟训诰互为表里。汉高祖最初想定都洛阳，听了娄敬的话，才定都关中。陛下一旦渡过长江，就把金陵作为建立国都的地方，这千秋万代的基业，本来就已经在此开始奠定了，所以说（这一点）不是汉高祖所能比得上的。
皇上说：“周家从公刘、后稷开始，世代积累忠诚厚道的品德，到文王的时候已经拥有天下的三分之二，武王才得到整个天下。”如果让周朝在那以后的君主不是成王、康王那样的君主，大臣不是周公、召公那样的大臣，进一步修养他们的品德，那么文王、武王的帝业，怎么能够达到八百年之久呢？《尚书》说：‘上天对人没有亲疏之分，只辅佐有德行的人。’假使我的后代子孙都像周成王、周康王一样，辅佐的大臣都像周公、召公一样，那么就可以祈求上天赐予永久的国运，国家的福运就会更加昌盛。侍臣叩头说：“陛下说的这番话，是宗庙社稷万年的福气啊。”
癸丑日夜晚，月亮侵犯了轩辕座右角星。
乙卯日，兰州卫指挥佥事萧起去世，朝廷派官员前去吊祭，抚恤他的家人。
任命承敕郎茹瑺担任通政使司右参议，给事中陈润担任户部右侍郎。
原元将校金铁马等人从辽东前来投降，皇帝下令赐给他们每人一套衣服。
追赠已故的龙虎卫指挥使胡斌为荣禄大夫、同知都督府事。诏书说：‘身披铠甲，露宿霜天，顶风冒雨，驱逐蛮夷，安定中国，像这样尊奉君主，不是英勇侠义之士，难道能做到吗？’以前西南各少数民族不遵守朝廷的政令教化，我命令大将率领三十万军队前去讨伐他们，各位将领听从命令，少数民族被平定。只是你战死在战场上，现在特别追封加赠为荣禄大夫、同知都督府事，在阴间报答你，让活着的人享受俸禄，死去的人享受祭祀，还有什么遗憾呢！胡斌，是都督胡海洋的儿子。（胡斌）跟随军队征讨云南，路过曲靖黑松林，突然遇到蛮寇，胡斌和他们作战，被流矢射中身亡，皇帝特别下令加升三等褒奖追赠。
西番打煎炉长河西土官、原元朝右丞剌瓦蒙再次派理问高惟善和他的侄子万户若剌来朝见，进献马匹和土特产，皇帝下令赐给他们不同数量的钞锭、衣服。
己未这一天，青海的酋长失剌巴等七个人，西番的酋长朵里只约等三个人前来归降，皇帝下诏书赏赐给他们数量不等的华丽丝织品和银锭。
夜里，有一颗红色的星星，从建星升起，向东南方向运行了二丈多远，有两颗小星跟随着它，（最后）到了云中消失了。
辛酉日，车里土族首领刀砍派他的侄子礼禄进献大象及当地特产，皇帝下诏赐给礼禄一套衣服，十锭钞。不久又赐给刀砍及礼禄织有金色花纹的精美丝织品九匹，绸缎也是九匹，钱钞八十锭，衣服五十件，因为他们当初带着贡品来朝廷朝拜的缘故。
壬戌日，西番打煎炉长河西的僧人答儿八坚千前来朝拜，皇帝赏赐给他一套僧衣。
癸亥日，赐给云南来投降的将校家属八百六十一人夏天的衣服。
丙寅日，皇帝对户部官员说：“凤阳是朕的故乡，那里有皇陵。从前汉高帝出生在丰、沛，发迹于丰、沛，他建立了帝业以后，丰、沛的百姓，一直到汉朝结束都受到恩惠。我现在永远免除凤阳、临淮二县的税粮和徭役，应该张贴告示晓谕百姓，让他们知道我的心意。
己巳日，召回回珀、珀到京城，赐给他们衣服、头巾、靴子、袜子。马依泽精通天文历法，在宁波府鄞县居住，有人把他的名字报告给皇帝，所以皇帝召见了他。
壬申日，皇帝命令四川布政使司：“从今以后，如果没有朝廷的旨意，不得擅自向蛮夷官司发文，以免引发边境事端。”
任命殿廷仪礼司序班杨盘担任国子监助教。杨盘起初担任江西参政，后来因事获罪被降为序班，到这时改任助教。
朝廷废除了天下府州县的提刑司和按察分司。当初，很多人向皇帝报告说地方官员贪婪卑鄙、违法乱纪，所以在直隶府、州、县设置了巡按监察御史，在各个布政司所属的地方设置了试佥事，都是由秀才担任，每个人都有印章，分别被派到郡县。不久以后，实行的措施大多违背常理，因此全部废除了。
命令刑部尚书开济商议拟定有关欺诈作伪的律条。
夏四月甲戌初一，皇帝在太庙举行祭祀。
乙亥日，皇上对身边的侍臣说：‘君主不能没有喜好崇尚的东西，关键应当谨慎对待（自己的喜好崇尚）。’大概喜好功劳，那么贪图名声的人就会被进用；喜好钱财，那么讲求财利的人就会被进用；喜好权术，那么游说空谈的人就会被进用；喜好阿谀奉承，那么花言巧语、奸佞的人就会被进用。那些偏爱自己所喜好的东西的人，很少有不使自己的内心受累的。所以喜好功业不如喜好德行，喜好钱财不如喜好廉洁，喜好权术不如喜好诚信，喜好阿谀奉承不如喜好正直。喜好符合正道，就没有不治理好的；喜好偏离正道，就没有不混乱的，所以不可以不慎重。
丙子日，任命承敕郎刘逢吉为吏部侍郎进行试用。
丁丑日。松州卫指挥佥事耿忠说：‘臣所管辖的松潘等处安抚司各簇长官司，应该根据户口数量，衡量他们的民力，每年命令他们缴纳马匹设立驿站，将他们的百姓登记为驿夫，来承担徭役。’皇帝听从了他的话。
夜里，有一颗青白色的星星，从狗国这个星宿升起，向西运行到天江这个星宿后消失。
戊寅日，设置长河西等处军民安抚使司，任命原来的元朝右丞剌瓦蒙为安抚使，赐给四十八匹绸缎，二百锭钱钞，任命其理问高惟善为礼部主事。
修筑松州以及叠溪的城墙。
己卯日，长河西安抚司土官油笼思卜前来朝见，皇帝赐给他袭衣、冠带。
诏令礼部：“从今以后，四夷以及各位土司入朝庆贺元旦的，不分远近，务必在京城附近的地区会集，一起进入京城朝见，不能让他们有先有后，有失朝仪。”
霸州奏报说：‘桑乾河从固安县到高家庄八十里，还有城西支河二十里，城南支河三十五里，因为年久失修而被堵塞，请求征发民夫疏通河道。’皇帝下诏命令等到农闲时再做这件事。
表彰松江府上海县主簿夏师颜的妻子赵氏，山阳县平民蔡仲铭的妻子夏氏，吕省九的妻子顾氏，和州平民周德新的妻子张氏，含山县平民张子文的妻子尹氏，任城县平民张衡的妻子全氏，临川县平民罗舜善的妻子饶氏、冯子宪的妻子饶氏贞节。
甲申日，大同府奏报：所属的蔚州、朔州去年降下严霜，损害了庄稼，百姓遭受饥荒。皇上命令永平侯谢成前往，发放粮食救济他们。
丁亥日，赐给羽林左卫征南的五百九十七名力士每人二匹布。
戊子日。皇帝晓谕兵部大臣说：‘自古以来国家设置军队，是为了保护百姓。’近来那些无知的百姓，凡是遇到军士逃亡的情况，常常把他们藏匿在家中，把触犯法令当作平常的事。你们兵部应该张榜公布这件事，如果有藏匿逃亡者的人，就命令他们将逃亡者送交官府，对于逃亡者和藏匿者不再追究，违反这个命令的人都要治罪。
皇考仁祖淳皇帝的忌日，皇上到奉先殿祭祀完毕后，用牺牲和甜酒到孝慈皇后的灵位前祭祀说：在我皇考忌日来临的时候，祭祀的礼仪，您的英灵不能参与，（我）怎能不极度感伤悲悼！
思南宣慰使田大雅、广西龙州知州赵帖坚因为孝慈皇后的丧事前来慰问，进献表章、贡马和地方特产，（朝廷）分别赏赐给他们绮帛和钞锭。
赐予文华殿大学士兼左中允全思诚退休归乡，皇帝下诏书说：‘我看古人之中，那些有志之人，虽然头发变白、气力衰退，但内心仍然不懈怠，所以能够善始善终，使名声留存于史册，光辉照耀后世。’你怀有才学、秉持品德，比得上古代有志向的人，可惜在这衰老的年纪，志向虽然还在但体力已经不能胜任（事务）了，朕不忍心再劳累你，特意命令你返回故乡，去抚养子孙，享受他们的奉养，不也是很愉悦的事吗？
任命土官普德暂时代理云南广西府的事务。
庚寅日，刑部尚书开济议论律法细密。皇帝看完后很厌恶地说：“设置刑罚，本来是为了禁止民众做坏事，让他们远离罪行，而不是为了陷害民众。”你用这种秘密的方法来欺骗无知的民众，用心是不是太狠了？竭泽而渔的做法，会伤害到小鱼小虾；焚林而猎的做法，会祸及幼鹿幼麋。（统治者）用这种巧妙严密（盘剥百姓）的方法，百姓难道能避免（受害）吗？这不是我对你的期望。王济非常惭愧。
辛卯日，追赠钱塘卫原千户袁兴为明威将军、指挥佥事。诏书说：‘中原已经安定，防御的重点在四方的夷族。’从前那些外族人不遵守教化，肆意妄为、强横跋扈，（朝廷）特地派遣征南将军率领三十万大军，到西南去兴师问罪，按照规定日期到达，击鼓列阵，那些外族人就溃败臣服了。只是你奋力投身于箭石（纷飞的战场），在边疆阵亡，朕因此哀伤悲悼，特别追赠（你为）明威将军、指挥佥事，（让你）世代享受俸禄、传承家业，（你的）名字书写在史册之上，永远不会磨灭。你如果在天有灵，就接受我这美好的命令吧。袁兴，全椒人，年少时喜欢骑马射箭，不从事生产活动。元朝末年发生战争，袁兴担任义兵百户。乙未年，率领部众前来归附，跟随军队攻克宣州，因为战功被提拔为千户。诸暨之战时，有一位刘总管，被贼人抓住，袁兴驱马快速冲入敌阵，贼人纷纷倒下，（袁兴）斩杀几十人，救出刘总管而回。后来见到了主帅，刘光世却把功劳全部归到了自己身上，郭兴却一点也不责怪他，也没有把这件事告诉别人，人们都佩服他的度量。士兵们曾经缺乏粮食，袁兴解下银带换粮食养活他们。等到朝廷的军队进攻云南的龙海时，袁兴当时随军出征，情绪激昂地对同僚说：‘我这次出征如果不能活捉贼首，就不回来。’到了这时，袁兴请求担任前锋，于是奋力作战而死。皇帝下诏派使者前去祭奠，加赠他现在的官职。
壬辰日，赐给国子监日本留学生文寿衣服、被褥、靴子和袜子。
普定军民府知府者额派弟弟阿昌和八十一砦长阿窝等人来朝贡马匹，皇帝下诏赐给他们不同数量的衣服和钱钞。不久又赐给每人二十匹彩帛、二百锭钞。
癸巳日，酉阳宣抚冉应仁进贡马匹和土特产，皇帝下诏赏赐文绮、钞锭。
乙未日，派使者带着勘合文册赏赐给暹罗、占城、真腊等国。凡是中国的使者到来，一定要查验勘合是否相同，否则就是伪造的，允许捉拿并上报。
丁酉日。皇帝诏令礼部：“凡是常规祭祀扬王时，使用一只羊、一头猪，祭祀太原长公主时，使用一只羊。”只有在每年的二月和八月的十五日进行两次祭祀，祭祀杨王时用太牢，祭祀太原长公主时用羊、猪各一头。
己亥日，宁国府宣城县的百姓申诉，原来元朝官府的田地征租太重，多年累积拖欠的田租达到十五万七千六百八十多石，百姓实在贫困，无法缴纳。户部把这件事上报给皇帝，皇帝下诏从辛丑年到洪武十三年的拖欠的租税全部免征。
原元朝海西右丞阿鲁灰派人到辽东，表示愿意归附明朝。皇上派遣使者带着敕令前去晓谕他说：‘只有聪明的人能够知晓生存和灭亡的道理，并且能判断出离开或者留下的时机。’现在你们所防守的地方，东边有野人的关隘，南边有高丽的险阻，北边连接着空旷的沙漠，只有西边抵达元军的营地，道路险要狭窄，谁不认为可以凭借这些来自我固守呢？你竟然能够率领众人归附朝廷，如果不是智慧之人能审时度势通达权变，是想不到这个办法的，即使是古代的志士，又怎么能超过你呢。我很赞赏他。现在特地派遣使者向你传达我的心意，你要知道。
云南品甸的本地首领杜惠前来朝见，皇帝任命他为千夫长。
《大明太祖圣神文武钦明启运俊德成功统天大孝高皇帝实录》第一百五十三卷。