就在洪承畴的主力在吐鲁番盆地击溃准噶尔铁骑，声威震动天山南北的同时，一支如同从地狱中钻出的军队，出现在了叶尔羌汗国最意想不到的方向——其东部腹地。
由暗卫四大统领李伟军、李二雄、李卫华、周雄率领的“青海商队”奇袭部队，历经数月艰难跋涉，穿越了被视为天堑的阿尔金山隘口，如同神兵天降，突然出现在且末、若羌一带的绿洲！
这支队伍早已褪去商旅伪装，亮出了锋利的獠牙。他们虽然人数不过数千，但极其精悍，装备精良，更携带着可快速拆装的轻型火炮和大量燧发枪。他们的出现，彻底打乱了叶尔羌汗国的防御部署。
叶尔羌东部各城的守军兵力薄弱，猝不及防。在暗卫精准的斩首行动和迅猛的突击下，且末守将开城投降，若羌望风归附。
奇袭部队以雷霆之势，沿着车尔臣河快速西进，兵锋直指叶尔羌汗国的东部门户——精绝、扜泥等城。
一时间，叶尔羌汗国东部谣言四起，风声鹤唳，通往汗国首都叶尔羌城（莎车）的东线大门，已然洞开！
几乎在同一时间，洪承畴在稳定吐鲁番地区后，亲率明军主力，浩浩荡荡沿天山南麓西进。大军并未强攻坚城，而是采取 “攻城为下，攻心为上”的策略。
明军首先兵临库车。
洪承畴遣使入城，递交《谕库车诸官民檄》，宣布：“王师此来，只为讨伐逆酋，恢复汉唐旧疆。顺者秋毫无犯，官复原职；逆者城破之日，玉石俱焚！”
库车城主阿奇木伯克本就与叶尔羌大汗有隙，又慑于明军兵威，在象征性抵抗一天后，便开城归降。洪承畴践行诺言，厚待降官，库车安然无恙。
消息传开，产生连锁反应。
阿克苏、乌什等城纷纷效仿，或降或走。
明军主力几乎兵不血刃，连下数城，兵锋直指叶尔羌汗国的心脏地带。
洪承畴每下一城，便张贴安民告示，废除叶尔羌的苛捐杂税，任用本地望族协助管理，秩序井然。
此时，叶尔羌汗国首都叶尔羌城内，已是一片末日景象。东有奇兵深入腹地，北有主力大军压境，败报频传。
大汗阿卜杜拉（史实人物，时任叶尔羌汗）又惊又怒，意图集结最后兵力，与明军决一死战。
然而，以他的弟弟伊思玛业勒（史实人物，后继位为汗）为首的主和派（主要由部分地方伯克、和卓宗教势力及商人集团组成），势力迅速抬头。
主和派看得非常清楚：明军战力恐怖，绝非己方能敌；且明军对待归顺者政策宽大，抵抗只有死路一条。
更重要的是，明军承诺保护商路，这对于掌控丝绸之路贸易的和卓和商人集团来说，具有致命的吸引力。
相反，大汗阿卜杜拉的顽固，只会将整个汗国拖入深渊。
一场宫廷政变在暗流中酝酿。
暗卫的渗透在此刻发挥了关键作用。
李卫华乔装潜入叶尔羌城，秘密会见了伊思玛业勒和主和派首领，出示了洪承畴的密信和崇祯皇帝的诏书（许以高官厚禄，承认其宗教地位），坚定了他们政变的决心。
崇祯八年正月，在一个寒冷的夜晚，伊思玛业勒联合宫廷卫队发动政变，软禁了大汗阿卜杜拉。
次日清晨，叶尔羌城头升起了白旗。伊思玛业勒派出使者，携带降表、户籍图册和城门钥匙，前往城外的明军大营乞降。
洪承畴率明军主力，举行了盛大的入城仪式。
大军军容整肃，秋毫无犯，缓缓开入这座中亚历史名城。
在叶尔羌汗宫前，伊思玛业勒率文武百官，跪迎大明钦差。
洪承畴代表崇祯皇帝，接受了投降，并宣布：
叶尔羌汗国灭亡，其原有疆域并入大明版图。
设立 “大明西域都护府”于叶尔羌城，洪承畴兼任首任都护。
册封伊思玛业勒为 “大明归义侯、西域都护府副都护”，协助管理地方事务。
宣布免税一年，废除苛政，保护所有宗教，重开丝路，减免商税。
谕令颁布，全城欢呼。
商人们尤其激动，他们知道，一个更强大、更有秩序的保护者，将带来前所未有的商业繁荣。
随着叶尔羌城的归附，塔里木盆地周缘的各大绿洲城市，如和田（于阗）、喀什噶尔、英吉沙等，传檄而定，纷纷派遣使者到叶尔羌城向洪承畴表示效忠。
至此，从哈密到帕米尔高原，整个塔里木盆地（南疆）再次纳入中原王朝的版图。
丝绸之路的南北两道，在沉寂了数百年后，再次被大明帝国贯通。
洪承畴站在叶尔羌城的城楼上，眺望着远方巍峨的昆仑雪山和脚下繁忙的市集，心中感慨万千。
这场历时近两年的西征，以一场教科书式的军事威慑与政治攻略相结合的完美胜利而告终。
大明不仅收复了广袤的疆土，更以一种相对低成本的方式，初步稳定了西域的局势。
崇祯八年春，西域都护府成立的捷报传至北京，举国欢庆。
崇祯皇帝在紫禁城大宴群臣，宣告 “汉唐旧疆，今朝重光”。
然而，无论是北京的崇祯，还是叶尔羌的洪承畴都明白，收复失地仅仅是第一步。
如何治理这片民族、宗教成分复杂的广阔土地，如何应对北方准噶尔部的威胁，如何真正实现长治久安，将是帝国面临的更大考验。
但无论如何，大明帝国的日月浪涛旗，已经插上了帕米尔高原。
丝绸之路的明珠，被再次擦亮。一个属于大明的西域时代，就此开启。
帝国的视野，已经投向了更遥远的西方——那片名为“中亚”的广袤土地。