万界联邦成立后的第三年，混元圣地的星纹研究院内，叶无殇正将最后一枚“法则稳定剂”投入改良后的药鼎。鼎身不再是盘古形态，而是融合了机械文明的精密齿轮与修真界的聚灵阵纹，表面流转着《黄帝内经》与《天工开物》交织的符文。“根据造化玉碟的推演，这种药剂能暂时抑制小世界中的混沌残留。”他对围在周围的各世界学者说，“但必须定期注射，否则...”
话未说完，研究院的警报突然响起。星痕的星纹罗盘在主控台上疯狂旋转，指针指向时空乱流最深处：“异常能量波动！不是来自永恒渊，而是...更遥远的时空！”林尘与苏瑶瞬间出现在控制台前，只见屏幕上的星图中，一个代表时空乱流的区域正在闪烁红光，红光中隐约可见金属与符文交织的建筑轮廓。
“那是...远古文明的遗迹？”苏瑶玉扇轻点，太阴之力解析着画面，“建筑风格融合了《山海经》的图腾与未来科技的结构，这不可能！”机械文明的首席科学家推了推光脑眼镜：“根据能量频谱分析，这些建筑的年代远超已知的任何文明，甚至...早于盘古开天？”
林尘的识海与造化玉碟产生共鸣，玉碟投影出一段模糊的记忆碎片：在一片混沌的空间中，漂浮着无数类似的金属建筑，建筑表面刻满无法解析的符文，而在建筑中央，似乎沉睡着某种恐怖的存在。“准备穿梭时空乱流。”林尘当机立断，“星痕，定位遗迹坐标；叶无殇，准备抗时空悖论的药剂；苏云，准备音波稳定装置；小桃，启动文化净化矩阵。”
穿梭过程比想象中更加凶险。时空乱流中漂浮着大量被混沌污染的时间片段，有的片段显示着某个世界被机械军团毁灭的末日景象，有的则是修真界灵气暴走的灾难画面，而这些片段的边缘，都缠绕着与永恒渊同源的黑色纹路。“不对，”星痕突然喊道，“这些片段的时间线，有的在我们战胜黑袍人之前，有的...在之后很久！”
叶无殇的改良药鼎突然爆发出刺耳警报：「检测到时间悖论反应物！建议立即撤离！」话音未落，一道时间乱流裹挟着无数金属碎片袭来。碎片上刻满《邪典》的逆反符文，其中一块碎片上清晰可见“混沌即未来”的字样。林尘挥出融合《过零丁洋》浩然正气的“人生自古谁无死”，混元剑气斩碎碎片，却见碎片粉末在乱流中重组为战斗傀儡。
“这些傀儡的核心程序...是被篡改的《九章算术》！”科技世界的学者惊呼。傀儡们组成严密的阵列，手中的能量武器射出的光束，竟能扭曲混元剑气的轨迹。苏云吹奏改编自《广陵散》的破阵曲，音波化作无形利剑刺入傀儡核心，却被内置的混沌防火墙反弹。小桃启动文化净化矩阵，《诗经》《楚辞》的金光照在傀儡上，竟被转化为混沌能量。
“它们在吸收文化力量！”林尘心头一震。他与苏瑶双生印记共鸣，施展出“混元双生·万象破”。剑光与月光交织成的太极图中，浮现出盘古开天与女娲补天的虚影，强行净化傀儡身上的混沌。但更多的金属建筑从乱流深处浮现，建筑表面的符文亮起，形成一个巨大的时空禁锢大阵。
“这是...来自未来的混沌势力？”苏瑶玉扇展开全力施为的“太阴星辉”，却无法撼动大阵分毫。林尘的识海与造化玉碟激烈共鸣，玉碟投影出的记忆碎片越来越清晰：那些金属建筑是某种囚笼，而囚笼中，沉睡着被称为“混沌子嗣”的恐怖存在，它们是永恒渊在多元宇宙中的分身，而黑袍人，只是其中一个分身的棋子。
“我们必须离开这里！”林尘当机立断。他燃烧部分混元道基，挥出“长风破浪会有时”的终极剑招，剑光劈开时空乱流的一角。众人鱼贯而出，回到混元圣地。但在离开前，林尘看到一座金属建筑的中央屏幕上，闪烁着一行用未知符文写成的警告，而在符文下方，赫然是黑袍人那熟悉的狞笑虚影——原来，永恒渊的威胁，远比他们想象的更加深远，而来自未来的混沌势力，已经悄然盯上了这个刚刚重建的万界...