以镇海岛为基地，凌云开始了对周边海域的探索。有海德尔这个熟悉海况的向导和王猛这群地头蛇的协助，效率高了很多。
根据王猛提供的线索和海德尔的知识，凌云将目标锁定在了几处传闻有上古遗迹或异常能量波动的海域。
第一处目标，是位于镇海岛东南方三千里的一片被称为“沉船墓地”的海域。那里暗流汹涌，海底沉没了无数古老的船只，据说其中隐藏着宝藏和秘密。
凌云独自一人，潜入深海。以他现在的实力，深海的压力和缺氧环境对他毫无影响。混沌龙神武魂让他对水有着天然的亲和力，在水中行动自如。
下潜数千米后，眼前出现了一片震撼的景象。巨大的海底峡谷中，密密麻麻地堆积着无数艘沉船的残骸，年代从近到远，有些船只的样式极其古老，甚至不是斗罗大陆的风格。残骸之间，游弋着一些发光的水母和奇特的深海鱼类，为这片死寂之地增添了一丝诡异的美感。
凌云神识散开，仔细探查着这些沉船。大部分沉船已经腐朽不堪，没什么价值。但当他探查到峡谷最深处时，发现了一艘半埋在泥沙中的、造型奇特的金属船只残骸。这艘船通体由一种未知的银色金属打造，虽然破损严重，但依旧能看出其精湛的工艺，船体上刻满了复杂的魂导符文，与现今的魂导技术截然不同。
“这不是这个时代的产物。”凌云心中一动，潜入残骸内部。船舱大部分已经坍塌，但在船长室，他发现了一个被能量护罩保护的金属箱子。
护罩的能量已经极其微弱，凌云轻易将其破除。打开箱子，里面没有金银财宝，只有几块残缺的玉简和一块巴掌大小、非金非玉、散发着微弱空间波动的令牌。
凌云拿起玉简，神识探入。玉简中记录的不是文字，而是一些残缺的图像和信息流，似乎是某种航行日志的片段。从破碎的信息中，凌云看到了浩瀚的星空、穿梭的星舰、以及……一场毁天灭地的恐怖大战！战争的双方，一方是类似魂师的强者，另一方则是……一些形态诡异、如同克苏鲁神话中的恐怖存在！
“域外邪魔？星际战争？”凌云心中巨震！这些信息，似乎揭示了斗罗大陆世界不为人知的远古秘辛！这个世界，曾经发生过星际级别的战争？对手是这些被称为“旧日支配者”的邪神？
他拿起那块空间令牌，令牌正面刻着一个复杂的星座图案，背面则是一个坐标。当他将魂力注入令牌时，令牌微微发光，指向某个特定的方向。
“这似乎是一个信标，或者……钥匙？”凌云将玉简和令牌收起。这些东西价值巨大，需要慢慢研究。
离开沉船墓地，凌云又探索了另外几处可疑海域，发现了一些上古魂师留下的洞府遗迹，得到了一些古老的功法和材料，但价值都比不上那艘外星飞船的发现。
这一日，海德尔带来一个新的消息：位于镇海岛正北方五千里外的“风暴之眼”海域，近期能量异常暴动，海底有强烈的空间波动，疑似有大型遗迹即将出世！
风暴之眼是海域着名的险地，常年被狂暴的雷暴和漩涡笼罩，船只难以靠近。但根据海德尔的描述，那里的异象与古籍中记载的“海神试炼”开启前的征兆有些相似。
“海神试炼？”凌云目光一闪。难道与海神传承有关？他决定前去一探。
乘坐破浪号，经过数日航行，抵达了风暴之眼外围。果然，前方的海面完全被漆黑的乌云和肆虐的闪电笼罩，巨大的漩涡如同漏斗般吞噬着海水，发出震耳欲聋的轰鸣！天地之威，令人心悸。
“凌长老，太危险了！我们还是……”船长看着那末日般的景象，脸色发白。
“无妨，你们在此等候。”凌云说完，身形一闪，便冲入了风暴之中！
一进入风暴范围，恐怖的雷暴和撕扯力便从四面八方袭来！但凌云周身混沌领域展开，将一切狂暴的能量隔绝在外，闲庭信步般在风暴中穿行。
他循着空间波动的源头，下潜至海底。在风暴之眼的最深处，他看到了令人震撼的一幕！
一座巨大无比、散发着蔚蓝色光芒、由水晶和珊瑚构筑而成的宫殿，正缓缓从海底升起！宫殿周围，环绕着七根通天彻地的巨大石柱，石柱上刻满了海神符文！强大的神性威压从宫殿中弥漫开来！
“海神殿？！真的是海神遗迹出世了！”凌云心中了然。看来，海神传承的剧情，因为某种原因（可能是他的到来引起的蝴蝶效应），提前开启了！
就在这时，他感应到好几股强大的气息，也从不同方向，正朝着海底宫殿急速赶来！
有海神岛的人，有圣灵教的人，还有……一些隐藏极深的海魂兽强者！
一场围绕海神遗迹的争夺战，即将在这深海之中爆发！