后来，荀攸跟随曹操前往白马救援刘延，他精心谋划，献上计策成功斩杀颜良，相关事迹在《武帝纪》中有详细记载。曹操攻克白马后回师，派遣运输物资的车队沿着黄河向西行进。袁绍见状，立即率军渡河追击，很快就与曹操的军队相遇。曹军众将看到这一幕，都惊恐万分，纷纷劝说曹操退回营寨坚守。荀攸却镇定地说道：“这正是我们擒获敌军的好机会，怎么能退走呢！”曹操听闻，看着荀攸，会心地笑了。于是，曹操下令用辎重车辆作为诱饵，敌军见到财物，纷纷争抢，顿时阵脚大乱。曹操趁机出动步兵和骑兵发起攻击，大破袁军，还斩杀了袁军的骑兵将领文丑。至此，曹操与袁绍在官渡形成对峙之势。
随着战事的持续，曹操的军队粮食即将告罄。荀攸向曹操进言：“袁绍的运粮车队早晚就会抵达，押运将领韩{荀大}（臣松之考证众多书籍，韩{荀大}的名字在不同记载中，有的写作韩猛，有的记作韩若，目前还不清楚哪个才是正确的）为人勇猛却轻敌冒进，我们出兵袭击，一定能够打败他。”曹操问道：“派谁去合适呢？”荀攸回答：“徐晃可以担当此任。”曹操依言派遣徐晃和史涣前去截击，成功打败了韩{荀大}，烧毁了袁绍的辎重粮草。
恰在此时，许攸前来投降，并告知曹操，袁绍派淳于琼等人率领一万多士兵押运粮草，这些将领骄傲自大，士兵们也懈怠散漫，此时前去偷袭定能得手。众人听闻，心中都充满疑虑，唯有荀攸和贾诩极力劝说曹操出兵。曹操于是留下荀攸和曹洪坚守营地，自己则亲自率领军队出击，一举攻破淳于琼的防线，将淳于琼等人全部斩杀。袁绍的将领张合、高览见大势已去，烧毁攻城器械后前来投降。袁绍见局势危急，只得弃军而逃。张合前来投降时，曹洪心中疑虑，不敢接纳。荀攸对曹洪说：“张合的计策不被袁绍采纳，心中恼怒才前来投奔，你有什么可怀疑的呢？”曹洪这才放心接纳了张合。
建安七年，荀攸跟随曹操前往黎阳征讨袁谭、袁尚。第二年，曹操原本准备征讨刘表，袁谭、袁尚却为了争夺冀州而大打出手。袁谭派辛毗向曹操投降，并请求曹操出兵救援。曹操就此询问部下的意见，部下大多认为刘表势力强大，应当先平定刘表，袁谭、袁尚不足为惧。荀攸却分析道：“当今天下纷争不断，刘表却只是坐守江、汉之间，由此可知他并没有争夺天下的志向。袁氏家族占据冀、青、幽、并四州之地，拥有十万大军，袁绍生前凭借宽厚的作风赢得众人的拥戴。倘若袁谭、袁尚兄弟和睦，共同守护这份家业，那么天下的战乱恐怕就难以平息。如今他们兄弟反目成仇，这种局面注定无法长久。如果一方吞并了另一方，他们的力量就会集中，那时再想消灭他们就困难了。我们趁着他们内乱的时候发起进攻，天下就能平定，这样的机会千万不能错过。”曹操听后，称赞道：“说得好。”于是答应与袁谭联合，回师击败了袁尚。后来袁谭背叛曹操，荀攸又跟随曹操出征，在南皮斩杀了袁谭。冀州平定后，曹操上表朝廷，为荀攸请封：“军师荀攸，自一开始就辅佐我，每次征战都跟随在侧，前后战胜敌军，都离不开他的谋略。”于是，荀攸被封为陵树亭侯。
建安十二年，曹操下令大规模论功行赏。曹操说道：“忠诚正直，在幕后出谋划策，安抚内外，荀彧当属首功，荀攸次之。”为荀攸增加食邑四百户，加上之前的，共计七百户。（《魏书》记载：曹操从柳城回师途中，特意前往荀攸家中，称赞荀攸前后出谋划策所立下的功劳，说道：“当今天下大局基本已定，我希望能与各位贤士大夫一同分享这份胜利的成果。昔日汉高祖让张良自己选择三万户的封地，如今我也希望你能自己挑选想要封的地方。”）之后，荀攸转任中军师。魏国刚刚建立时，荀攸担任尚书令。
荀攸为人心思缜密，富有智谋，且善于自我保全。自从跟随曹操四处征伐，他常常在营帐中出谋划策，当时的人和他的子弟都不知道他具体说了什么。（《魏书》记载：荀攸姑姑的儿子辛韬曾经询问荀攸曹操夺取冀州时的情况。荀攸回答说：“是辛毗为袁谭前来请求投降，朝廷大军前去平定，我并不清楚其中的细节。”此后，辛韬以及荀攸的家人、外人都不敢再询问军中事务和国家大事。）曹操常常称赞荀攸：“公达表面看似愚笨，实则充满智慧；表面显得怯懦，实则勇敢无畏；表面看着柔弱，实则内心强大。他从不夸耀自己的长处，也不宣扬自己的功劳。他的智慧别人或许可以企及，但他那看似愚笨的低调处世之道，别人却难以做到，就算是颜回、甯武子也比不上他。”曹丕身为太子时，曹操告诫他：“荀公达是众人的表率，你应当以最高的礼节敬重他。”荀攸生病时，曹丕亲自前往探望，独自一人在床边下拜，荀攸受到的尊崇由此可见一斑。
荀攸与钟繇交情深厚，钟繇曾说：“我每次有所行动，都会反复思考，自认为已经没有更好的办法了。可拿去请教公达，他给出的意见总是超乎我的预料。”荀攸前后共献上十二条奇谋妙计，只有钟繇知晓。钟繇原本打算将这些计策整理成册，却还没完成就去世了，因此世人无法全部了解这些计策。（臣松之认为：荀攸去世十六年后，钟繇才离世，整理荀攸的奇策并非难事。钟繇活到八十岁，却还说没有完成，这使得荀攸跟随曹操征战时的奇谋妙计未能流传于世，实在令人惋惜！）
荀攸跟随曹操征讨孙权，在途中不幸去世。曹操每次提及他，都会伤心落泪。（《魏书》记载：荀攸去世时是建安十九年，享年五十八岁，推算起来，他比荀彧大六岁。《魏书》中记载曹操的命令：“我与荀公达一同征战二十多年，他没有任何地方值得指责。”又说：“荀公达真是一位贤人，正所谓‘凭借温和、善良、恭敬、节俭、谦逊的品德获得众人的认可’。孔子称赞‘晏平仲善于与人交往，交往越久，别人越敬重他’，公达就是这样的人。”《傅子》记载：有人询问近代的大贤君子有哪些，回答说：“荀彧的仁德，荀攸的智谋，这两人可以称得上是近代的大贤君子。荀彧以仁爱树立德行，凭借明智举荐贤才，行为正直不谄媚，谋略能够应对各种危机。孟子说‘每过五百年就会有圣明的君主兴起，这期间必定会有闻名于世的贤才出现’，荀彧或许就是这样的人吧！曹操也曾称赞‘荀彧举荐贤才，不举荐到满意绝不罢休；荀攸铲除奸恶，不铲除干净绝不停止’。”）
荀攸的长子荀缉，颇有荀攸的风范，可惜早早离世。次子荀适继承了荀攸的爵位，却没有子嗣，导致家族爵位断绝。黄初年间，朝廷追封荀攸的孙子荀彪为陵树亭侯，食邑三百户，后来又转封他为丘阳亭侯。正始年间，朝廷追谥荀攸为敬侯。