太平三年（公元 258 年）春正月，诸葛诞杀了文钦。三月，司马文王攻克寿春，诸葛诞和他身边的人战死，将领官吏以下的人都投降了。秋七月，朝廷封原来的齐王孙奋为章安侯。下诏让各州郡砍伐修建宫殿的木材。从八月开始，天气阴沉不下雨，一直持续了四十多天。孙亮因为孙綝专权放纵，和太常全尚、将军刘丞谋划诛杀孙綝。九月戊午日，孙綝派兵抓走全尚，派弟弟孙恩在苍龙门外攻打并杀死刘丞，召集大臣在宫门会合，把孙亮废黜为会稽王，当时孙亮十六岁。
孙休，字子烈，是孙权的第六个儿子。十三岁时，跟从中书郎射慈、郎中盛冲学习。太元二年（公元 252 年）正月，被封为琅邪王，居住在虎林。四月，孙权去世，孙休的弟弟孙亮继承皇位，诸葛恪执掌朝政，他不想让各诸侯王居住在长江沿岸有兵马的地方，就把孙休迁到丹杨郡。太守李衡多次借故侵扰孙休，孙休上书请求迁到其他郡，朝廷下诏把他迁到会稽。住了几年后，孙休梦见自己乘龙上天，回头却看不见龙尾，醒来后觉得很奇怪。
孙亮被废黜后，己未日，孙綝派宗正孙楷和中书郎董朝去迎接孙休。孙休起初听到消息，心里还有疑虑，孙楷、董朝详细说明了孙綝等人奉迎他的本意，孙休停留了一天两夜，才出发前往。十月戊寅日，走到曲阿，有位老人拦住孙休叩头说：“事情拖久了就会发生变故，天下人都在期盼着您，希望陛下快点赶路。” 孙休认为老人说得对，当天就行进到布塞亭。武卫将军孙恩代理丞相事务，率领百官用皇帝的车驾仪仗在永昌亭迎接，还修筑了宫殿，用武帐作为便殿，设置了御座。己卯日，孙休到达，看到便殿就停下了，派孙楷先去见孙恩。孙楷回来后，孙休乘坐辇车前进，群臣再次下拜称臣。孙休登上便殿，谦逊地没有立刻坐到御座上，而是在东厢房休息。户曹尚书上前到台阶下宣读奏书，丞相献上玺印符节。孙休三次推让，群臣三次请求。孙休说：“将相诸侯都推举我，我怎敢不接受玺印符节呢？” 群臣按次序引导，孙休登上皇帝的车驾，百官在旁陪侍，孙綝率领一千名士兵在城郊半路迎接，在道路旁边下拜，孙休下车回拜。当天，孙休亲临正殿，大赦天下，改变年号。这一年，对应魏国的甘露三年（公元 258 年）。
永安元年（公元 258 年）冬天十月壬午日，孙休下诏书说：“嘉奖有德行和功劳的人，是从古到今都通行的道理。任命大将军孙綝为丞相、荆州牧，增加五个县的封地。武卫将军孙恩为御史大夫、卫将军、中军督，封为县侯。威远将军孙据为右将军、县侯。偏将军孙干为杂号将军、亭侯。长水校尉张布在辅佐过程中勤劳有功，任命张布为辅义将军，封为永康侯。董朝亲自去迎接我，封为乡侯。” 又下诏书说：“丹阳太守李衡，因为过去有嫌隙，自己把自己拘禁到有关部门。春秋时管仲曾射中齐桓公的带钩，寺人披曾斩断晋文公的衣袖，但他们后来都能为君主效力，派李衡回丹阳郡，让他不要自我怀疑。”
《襄阳记》里记载：李衡，字叔平，原本是襄阳兵卒家庭的儿子，汉朝末年到吴国成为武昌的平民。他听说羊衟擅长识别人才，就去求见他，羊衟说：“在这多事的年代，你是尚书剧曹郎那样的人才。” 当时校事吕壹玩弄权柄，大臣们都受到胁迫，没人敢说话，羊衟说：“除了李衡没人能困住吕壹。” 于是一起推荐李衡为郎官。孙权召见李衡，李衡口头陈述吕壹的奸邪短处达几千言，孙权听了面露愧色。几个月后，吕壹被诛杀，李衡也得到了极大的提拔。后来李衡常担任诸葛恪的司马，办理诸葛恪府中的事务。诸葛恪被诛杀后，李衡请求担任丹阳太守。当时孙休在丹阳郡治所，李衡多次用法律约束他。李衡的妻子习氏常常劝谏他，李衡不听。等到孙休即位，李衡又担忧又害怕，对妻子说：“没听你的话，才到了这地步。” 于是想逃到魏国去。妻子说：“不行。你本来就是平民，先帝对你提拔过重，你已经多次对琅邪王无礼，现在又反过来猜疑，叛逃求活，这样向北投奔魏国，有什么脸面见中原的人呢？” 李衡说：“那有什么办法？” 妻子说：“琅邪王向来喜欢做善事、仰慕名声，正想在天下人面前显露自己，终究不会因为私人嫌隙杀你，这是很明显的。你可以自己囚禁自己到监狱去，上表陈述以前的过失，公开请求受罚。这样，反而会受到优待宽恕，不只是能活下来而已。” 李衡听从了妻子的建议，果然没遭祸患，还被加封为威远将军，授予棨戟。李衡常常想治理家业，妻子总是不允许，后来他秘密派了十个门客在武陵龙阳的汜洲上建造住宅，种了一千棵柑橘树。临死前，李衡告诫儿子说：“你母亲不喜欢我治理家业，所以家里才这么穷困。但我在州里有一千个‘木奴’，不用向你索要衣食，每年献上一匹绢，也足够用了。” 李衡死后二十多天，儿子把这事告诉了母亲，母亲说：“这应该是种的柑橘，你家失去十个门客已经七八年了，一定是你父亲派他们去建造住宅的。你父亲总说太史公的话，‘江陵有一千棵橘树，相当于封侯之家’。我回答说：‘人只怕没有德义，不怕不富裕，如果地位尊贵却能保持清贫，才好呢，要这些有什么用！’” 吴国末年，李衡种的柑橘有了收成，每年能得几千匹绢，家境变得富足。晋朝咸康年间，他住宅的旧址和枯树还在。
己丑日，孙休封孙皓为乌程侯，孙皓的弟弟孙德为钱唐侯，孙谦为永安侯。《江表传》记载：群臣上奏请求立皇后、太子，孙休下诏说：“我凭借微薄的德行，继承大业，处理政事的时间不长，恩泽还没广泛施布，加上后妃的封号，确立太子的位置，不是眼下紧急的事。” 有关部门又坚决请求，孙休谦虚地不答应。
十一月甲午日，风向四次转变又五次回复，大雾接连下了好几天。孙綝一家有五人封侯，都掌管禁军，权力超过君主，他有所陈述，孙休表面上恭敬而不违背，于是孙綝更加放纵。孙休担心他会发动叛乱，多次给予赏赐。丙申日，孙休下诏书说：“大将军孙綝发自内心地忠诚，首先提出大计来安定国家，朝廷内外的官员，都赞同他的提议，并且都有功劳。从前霍光制定大计，百官同心协力，也不能超过现在。赶快核查前些天参与商议决定大事并报告祖庙的人员名单，按照旧例应该加授爵位的，抓紧施行。” 戊戌日，下诏说：“大将军掌管朝廷内外各种军事，事务繁多，加授卫将军御史大夫孙恩为侍中，和大将军分别处理各种事务。” 壬子日，下诏说：“官吏家中有五人或三人同时承担繁重徭役，父亲兄长在都城，子弟在郡县当差，既已缴纳限米，军队出征又要跟从，以至于家中事务无人照管的，我很怜悯他们。那些有五人或三人服徭役的，听凭他们的父亲兄长留下想要留下的人，留一人，免除他的米限，军队出征也不用跟从。” 又说：“各位将吏在永昌亭奉迎陪同的，都加升一级官位。”
不久，孙休听说孙綝有叛逆的阴谋，暗中和张布谋划计策。十二月戊辰日腊祭，百官朝贺，公卿登上殿堂，孙休下诏让武士捆绑孙綝，当天就把他处死了。己巳日，孙休下诏因左将军张布讨伐奸臣有功，加授张布为中军督，封张布的弟弟张惇为都亭侯，给予三百名士兵，张惇的弟弟张恂为校尉。
孙休下诏书说：“古代建立国家，把教育放在首位，是为了引导世人陶冶性情，为当时培养人才。自建兴年间以来，时局多有变故，官吏百姓多因眼前的事务奔走，抛弃根本追逐末节，不遵循古代的正道。所崇尚的不淳厚，就会损害教化败坏风俗。要按照古代制度设置学官，设立五经博士，考核选取合适的人选，给予他们优厚的待遇，从现任官吏以及将吏子弟中有志向爱好的人中，让他们各自入学学习。一年后进行考核，区分他们的等级，给予官位和赏赐。让看到的人羡慕他们的荣耀，听到的人向往他们的声誉。以此敦厚王道教化，兴盛良好风俗。”