郊外的废墟中，三道身影突然闪现。三人穿着的杀戮都市强化服不断流淌着透明液体，表面的光泽逐渐黯淡，隐身功能彻底失效——这是强化服抵达极限的征兆。
“还好绮力反应快……”雾牙喘着粗气，擦去嘴角的血迹，“S2机关爆炸前弹出驾驶舱，靠你的防御屏障才活下来。”
绮力点点头，脸色苍白：“NERV总部已经彻底混乱，我们暂时安全了。”
三人相互搀扶着，消失在夜色中。
病房里，碇真嗣缓缓睁开眼睛，熟悉的白色天花板映入眼帘，可身边却空无一人——没有葛城美里的担忧，没有绫波丽的沉默，也没有御神言的沉稳身影。他动了动手指，浑身传来撕裂般的疼痛，脑海里却不断回放着爆炸前的最后一幕：渚薰展开At立场挡在他身前，御神言的紫色魔法光芒在混乱中一闪而逝，随后便是无尽的炽热与黑暗。
“御神司令……渚薰……”碇真嗣的声音带着颤抖，悲伤如同潮水般将他淹没。他蜷缩起身体，眼泪不受控制地涌出，砸在洁白的床单上。
距离上一次这样痛哭，仿佛已是遥远的过去——一直以来，御神言的存在就像定心丸，只要有那个人在，再棘手的困境似乎都能被解决，可现在，那个能给他安全感的人，却永远消失在了爆炸里。
空旷的病房里，只剩下压抑的哭声，在寂静中不断回荡。
病房门外，葛城美里攥紧拳头，脚步停在原地。她刚从混乱的总部赶来，却只能隔着门板听见里面压抑的哭声，终究没有推门进去——此刻的碇真嗣，需要的或许不是安慰，而是独处的空间。她靠在冰冷的墙壁上，脑海里不断闪过如果自己当时在指挥室，是否能阻止这场灾难的念头，愧疚像藤蔓般缠绕住心脏。
哭泣过后的病房里，死寂笼罩着一切。碇真嗣瘫坐在床上，心中满是空洞的茫然，可脑海里却反复浮现御神言的话语——那些关于“责任”与“为守护而战”的教导，像微弱的光，勉强撑起他沉重的躯体。他拔掉身上的检测仪器，针头扯出皮肤时的刺痛都变得麻木，此刻他只想找个人，好好倾诉积压在心底的恐惧。
踉跄着穿过走廊，每一步都像踩在棉花上，直到站在明日香的病房门前，他才停下脚步。推开门，看到依旧躺在病床上、毫无动静的明日香，碇真嗣紧绷的神经骤然松弛，他跪坐在床边，轻轻握住明日香的手，那双手冰凉得让人心慌，他却像抓住救命稻草般攥紧，仿佛在向神明祈祷。
“明日香……”他的声音带着未散的哭腔，泪水又忍不住涌出，“我真的撑不下去了，可又不能停下……为了世界，为了大家，这担子好沉……我已经不知道该怎么战斗了。”他哽咽着，将额头抵在两人交握的手上，“御神司令走了，绫波也不见了，现在只有我一个人要开EVA……我好害怕，这样软弱的我，真的能挡住末日吗？”
“你是我女朋友啊，明日香……帮帮我，拜托了。”他祈求着奇迹，哪怕只是一丝回应，也能让他稍微站稳。
就在这时，一只纤细却带着力量的手，轻轻抚上他的脸颊，抹去了他的眼泪。碇真嗣猛地抬头，撞进明日香睁开的、带着些许疲惫却依旧锐利的眼眸里。
“笨蛋真嗣。”明日香的声音带着刚苏醒的沙哑，却透着不容置疑的坚定，“到最后还是要靠我吗？放心，我会陪你一起。”
短短一句话，像一道光刺破了碇真嗣心中的黑暗。他看着眼前苏醒的明日香，突然觉得原本灰暗的世界重新染上了色彩，紧绷到极致的神经终于放松，眼泪再次落下，这一次却带着失而复得的暖意。
与此同时，第三新东京市的医院废墟里，御神言缓缓睁开眼睛。浑身的疼痛让他倒吸一口凉气，环顾四周，断壁残垣间散落着医疗器材，地表城市因使徒袭击早已沦为废墟。身上的绷带缠绕得十分熟练，显然是有人精心处理过。他转头看向旁边的病床，渚薰还未苏醒，监护仪上跳动的曲线却显示生命体征平稳。
“吱呀——”病房门被推开，加持良治举着文件夹走进来，看到御神言清醒，眼中闪过一丝惊讶：“没想到御神司令不仅是NERV的高层，还是‘空想天使’。我该感谢你之前的不杀之恩，还是埋怨你夺走了我手里的亚当？”
御神言此刻仍维持着魔法少女的姿态，清脆悦耳的声音里带着一丝虚弱，却直接无视了他的调侃：“当时的情况，轮不到你插手。我们究竟是怎么活下来的？”
“啧啧，真不习惯你这娇滴滴的声线。”加持良治笑着调侃，见御神言指尖凝聚起淡紫色魔力光束，立刻举手投降，“别激动，是绫波丽带你们来的。她用At立场护住了你们，我只是找了这个藏身地，做了些基础治疗，你们能活下来，主要靠自身恢复力。”
御神言垂下眼，心中了然——应该是莉莉丝的灵魂容器（绫波丽）与亚当的灵魂容器（渚薰）产生接触，让绫波丽彻底觉醒，才能释放出足以抵御S2机关爆炸的At立场。他看向窗外的废墟，暗自感叹：这一次，真是彻头彻尾的完败。
短暂的休养生息，终究抵不过世界前进的齿轮。初号机与二号机还在维修厂的支架上泛着冷光，第三新东京市的废墟上空，却突然掠过刺耳的破空声——不是使徒的嘶吼，而是人类自己的武器。