通州漕运码头的喧嚣，在林琛眼中逐渐沉淀为一系列亟待解决的具体问题。徐阶的“鼎力支持”与张居正的“协理”，如同在这潭深水中投入了两颗石子，涟漪之下，是更深层的暗流。林琛深知，整顿漕运，疏通河道易，疏通人心难。
送走徐阶后，林琛并未立刻返回驿馆，而是带着张居正、王启年、张润、陈渠等人，沿着漕河堤岸步行勘察。他没有理会闻讯赶来、诚惶诚恐的通州知州和漕运分司的官员，只让他们远远跟着。
“张主事，”林琛指着一段淤塞尤为严重、河面几乎与堤岸齐平的河道，“你看此处，漕船通行，需数十纤夫全力拉扯，一日不过数里。损耗人力物力不说，更延误漕期。依你之见，当务之急为何？”
张居正虽年轻，但目光敏锐，思维缜密。他仔细观察了河道走向、水流情况以及两岸地形，沉吟道：“回部堂，下官以为，清淤固是根本，然需先理清权责，统一调度。如今疏浚之事，漕督衙门、工部都水司、乃至地方州府皆有涉足，却各自为政，经费、人力分散，甚至相互推诿。若不能整合力量，划定权责，即便有良法，亦难施行。”他点出的，正是徐阶之前顾虑的“协调不易”的核心。
林琛赞许地点点头：“张主事所言，切中管理之弊。此事，便交由你与张郎中（张润）会同漕督衙门，三日内厘定章程，明确此段漕河疏浚工程，由谁主导，谁协理，钱粮如何划拨，人力如何征调，功过如何考核。我要见到一份清晰的条陈。”
“下官领命！”张居正与张润齐声应道。张居正眼中闪过一丝讶异，没想到林琛如此干脆地将协调各方关系的棘手任务交给了自己这个“新人”，这既是信任，也是考验。
“陈主事，”林琛又转向格物院水利科的陈渠，“你带人，依据这两日勘测的水文数据，立即着手设计详细的疏浚方案。何处该深挖，何处该拓宽，何处可筑简易导流坝以水攻沙，需有明确图示与工程量估算。记住，我要的不是纸上谈兵，是能立刻指导施工的图纸！”
“是！部堂！属下已有些眉目，今夜定将初稿呈上！”陈渠信心满满，摩拳擦掌。
林琛又对王启年低声吩咐了几句，王启年点头，悄然离去，他的任务是利用林琛在锦衣卫和京营中的关系，暗中查探漕运系统内部，尤其是那些与严党有牵连、或可能阻挠新政的“硬钉子”。
安排妥当，林琛才仿佛刚看到那些远远候着的当地官员，招了招手。通州知州和漕运分司的主事连忙小跑上前，躬身行礼，额上见汗。
“本官奉旨整顿漕运，尔等皆乃地方父母，漕运干吏，当知此事关乎国计民生，关乎尔等前程。”林琛语气平淡，却自带威严，“以往种种，既往不咎。但从即日起，需全力配合工部与格物院行事。若有阳奉阴违、推诿塞责者，严惩不贷！”
“下官明白！定当竭尽全力，配合部堂大人！”两位官员连声保证，心中却是七上八下。这位林尚书年轻气盛，手段凌厉，连严党都扳倒了，他们这些小虾米哪里敢有丝毫怠慢。
接下来的几日，通州漕运码头周边仿佛变成了一个巨大的工地与实验室的结合体。
张居正与张润展现了惊人的效率与手腕。他们召集了漕督衙门、工部都水司驻通州官员、以及通州地方官员，连续两日闭门会议。张居正引经据典，条分缕析，张润则提供技术层面支持。面对各方扯皮与利益诉求，张居正时而以大势压人，时而以利益诱导，最终在林琛的权威背书下，硬是厘定了一份权责清晰、赏罚分明的《通州段漕河疏浚暂行章程》，明确规定以此番工部主导，格物院提供技术支持，漕督衙门及地方协理人力物资，所需钱粮由漕银及部分追缴赃款先行垫付，事毕核销。章程呈报林琛，林琛略作修改，便朱笔批准，即刻生效。
而格物院这边，更是成果斐然。陈渠带领水利科成员，依据精确测量，绘制出了详细的河道疏浚施工图。哪里需要重点清淤，哪里可以适当拓宽以提升流速，甚至在哪里设置临时的、利用水流自身力量冲刷淤泥的“束水冲沙”工事，都标注得一清二楚。更引人注目的是，他们根据林琛的指导，设计了几种新式的疏浚工具：利用滑轮组省力的大型挖泥耙，以及一种依靠畜力或人力驱动的、可以连续将河底淤泥提出水面的“链斗式”简易清淤装置模型。虽然简陋，但其思路之新颖，让见惯了原始人挖肩扛的老河工们都啧啧称奇。
然而，阻碍也随之而来。
章程颁布，工程即将启动，需要大量征调民夫。以往，这都是地方胥吏和漕帮把头们捞油水的大好机会，克扣工钱、虚报人头是常事。此番林琛明令，民夫工钱由工部直接派人按日发放，登记造册，杜绝中间盘剥。这无疑断了某些人的财路。
这日清晨，王启年匆匆找到正在视察工具打造进度的林琛，低声道：“部堂，果然有人坐不住了。漕帮的几个把头，还有州衙的几个胥吏，暗中串联，鼓动了不少民夫，说是……说是格物院的新法子劳民伤财，还不保险，用那奇奇怪怪的家伙什，怕是要出人命，不如用老法子踏实。现在不少民夫心存疑虑，不肯应征，甚至有些已经在场的，也消极怠工。”
林琛闻言，眼中寒光一闪。他早就料到会有人利用信息不对称和民众的保守心理来制造阻力。
“带头的是谁？查清楚了吗？”
“查清楚了，主要是漕帮一个叫赵黑虎的把头，此人掌控着通州码头大半的苦力，与之前严党在漕运上的人关系密切。还有州衙一个户房的书办，叫钱贵，也是个雁过拔毛的主。”
“好。”林琛冷笑，“正愁杀鸡儆猴，没有合适的目标。”
他并没有立刻采取强硬手段，而是对陈渠道：“陈主事，将我们那套‘链斗式’清淤装置组装起来，今天就在最淤塞的那段河道，进行公开演示！让所有民夫、船工、乃至来往客商都来看看！”
他又对张居正道：“张主事，劳你出面，以协调章程、保障民夫权益的名义，将赵黑虎、钱贵以及相关胥吏、把头‘请’到演示现场。我要让他们亲眼看看，什么是‘格物’之力！”
张居正心领神会，知道林琛这是要技术破谣，人心立威，立刻应下。
午后，那段淤塞严重的河道两岸，围满了看热闹的人群。有被征调来的民夫，有码头工人，有船家，也有闻讯赶来的百姓。赵黑虎、钱贵等人也被“客气”地请到了前排，两人脸上带着不屑与隐隐的不安。
河面上，那架简陋却结构巧妙的“链斗式”清淤装置被架设起来，由四头健牛牵引。随着陈渠一声令下，牛力通过齿轮传动，带动链斗缓缓转动，一个个斗子深入河底，挖起满斗的乌黑淤泥，提升到高处后倾倒在岸边的指定区域。整个过程连贯、省力，效率远超人工挖掘！
岸上的人群发出阵阵惊呼！
“嚯！这玩意儿厉害啊！一斗顶我们挖半天！”
“看着是省劲儿！不用泡在冷水里！”
“这泥挖得也深！”
陈渠趁机大声讲解原理，并让几个自愿的民夫上前尝试操作，感受其省力与高效。
林琛走到人群前方，目光扫过脸色变幻不定的赵黑虎和钱贵，声音朗朗，传遍河岸：“诸位乡亲父老！此乃格物院所制清淤利器，非是奇技淫巧，乃是依据力学之理，借自然之力，为人省力增效！以往疏浚，民夫辛苦，效率低下，皆因工具落后，法子笨拙！如今用此新器，一人可抵数人之功，工期可大大缩短，尔等亦可早日完工，领取足额工钱回家！”
他顿了顿，语气转厉，目光如电般射向赵黑虎等人：“然，本官听闻，竟有宵小之辈，散布谣言，蛊惑人心，阻挠新政，意图继续盘剥尔等血汗钱！此等行径，与昔日严党何异？！本官今日把话放在这里，漕运整顿，势在必行！凡顺应者，工钱加倍，有功者赏！凡阻挠者，无论何人，严惩不贷！”
他手一挥，王启年立刻带着几名护卫，将面如土色的赵黑虎和钱贵当场拿下！
“将此二人，并一干涉案胥吏，押送州衙大牢，严加审讯！将其罪行，张榜公布，以儆效尤！”
雷霆手段，配合着眼前实实在在的技术展示，瞬间摧毁了所有的谣言与侥幸。民夫们亲眼看到了新工具的效率，听到了工钱加倍的承诺，又见平日里作威作福的把头胥吏被当场法办，疑虑尽消，转而爆发出巨大的热情。
“林青天！”
“我们愿意干！”
“跟着林尚书，用新家伙！”
欢呼声如同春雷，滚过漕河两岸。
张居正站在林琛身侧，看着眼前群情激昂的景象，看着那高效运转的清淤装置，再看向身旁这位比自己还要年轻几岁，却已手握重权、手段老辣的工部尚书，心中波澜起伏。他看到了技术的力量，更看到了林琛将技术、权术、人心结合运用的高超手腕。
“清淤，不仅要清河道之淤，更要清人心之淤，吏治之淤。”林琛望着重新变得热火朝天的工地，对张居正淡淡道，“张主事，这只是开始。后面的硬仗，还多着呢。”
张居正肃然拱手：“下官，愿随部堂，涤荡沉疴，共开新局！”
淤泥与人心，在格物的力量与政治的决断下，开始同时松动。通州漕运的变革，终于迈出了艰难而坚实的第一步。